日本のパン、ジャぱんを作る!名作復活!前作、焼きたて!!ジャぱんの続編。
前作の漫画やアニメに影響を受けた少年が、この現実世界で、日本人による日本人のためのパン=ジャぱん作りを目指す!
イギリスパン、ドイツパン、フランスパンはあれど、ジャぱんはない。だから作るのじゃ!という漫画&アニメが『焼きたて!!ジャぱん』。そしてその作品内容に憧れ、本当にパン職人になってしまった少年が弘見大作。しかしながら、パン職人の現実は厳しい。朝は早く起き夜は遅くまで働き、ジャぱんなどというパンが認められるわけでもない。そんな切ない日々を送る大作の元へ、現れた謎の美少女。彼女が大作の運命を変える!?